商丘卫生中等专业学校始建于1958年，原为商丘市人民政府于批准设立的“商丘市卫生学校”(花园卫校)，1988年由商丘市人民政府申报，经河南省教委批准成立“商丘市卫生职业中等专业学校”，2006年3月，经商丘市教育局批准、河南省教育厅备案、河南省卫生厅评估认定，更名为“商丘卫生中等专业学校”，正式纳入普通中专管理；2010年8月搬入新校区，占地面积230余亩，包括教学楼、餐厅、实验楼、学生公寓（男、女学生公寓各一幢）、超市、青少年活动中心和羽毛球多功能运动场等建筑设施；现举办专业有：护理、助产、医学检验技术、药剂、康复技术、营养与保健、中药和眼视光与配镜八个专业。

商丘卫生中等专业学校和新乡医学院于2005年8月联合成立新乡医学院成教商丘教学点，举办有专科、本科和高起本层次的医学类相关专业，提升周边在职职工学历层次。