广西钦州农业学校的前身是广东省合浦县立农业职业学校，1933年10月1日在合浦县张黄镇（今广西壮族自治区浦北县）创办。是广西历史最悠久的一所中专学校。1951年12月改为广西省办，并迁至钦州现址。
由于行政区域和隶属关系的改变，学校曾几度易名。1952年1月，奉广西省农林厅批复，名为“广西钦州农业技术学校”，由广西壮族自治区农林厅领导。1953年春，按省农林厅通知，改名“广西省钦州农业学校”。1955年秋，钦州专区划归广东省管辖并改为合浦专区，学校则由广东省农业厅领导，校名为“广东省钦县农业学校”。1957年秋，合浦农校并入广西钦州农业学校。1958年9月，学校升格为“华南农学院合浦分院”，后合浦专区并入湛江专区，分院并入华南农学院湛江分院，学校继续办中专。1965年8月，原合浦专区区域再次划归广西管辖并成立钦州专区，此时校名为“广西钦州农业学校”，归广西壮族自治区农业厅领导。1969年秋，学校由广西壮族自治区下放钦州地区行署领导，改名为“广西钦州地区农业学校”。1969年9月－1975年8月，由于中专在校生较少，这段时间经钦州地区行署批准曾开办钦州地区农校附设中学。1980年11月13日，经广西壮族自治区人民政府批准，广西钦州农业学校收归自治区农业局（现广西壮族自治区农业厅）领导，更校名为“广西钦州农业学校”至今。
广西钦州农业学校办学条件完善、实力雄厚。截至2007年春季，学校占地面积25公顷，建筑面积6万多平方米。拥有功能齐全、配套合理的教学、科研、实验实训、生活用房和现代化的教学实验设备；拥有一支水平高、素质好的师资队伍，其中具有高级技术职务者25人，中级技术职务者86人；拥有农业技术服务公司、副食品生产基地、实习农牧场、花卉苗木场、现代农业实验示范园等校办产业、教学生产实践基地。实现了教学过程现代化、技能实践基地化、师资结构合理化、生产基地产业化、学生住宿公寓化。
广西钦州农业学校始终坚持社会主义办学方向，坚持教育教学改革，坚持为“三农”服务。充分发挥学校特有的社会功能，根据经济社会发展的要求拓展办学领域，在发展职业教育方面积极探索，大胆实践，为社会培养高素质的劳动者和专业技术人才。形成了集农、工、商、管理、服务相结合多学科的中等职业学校。截至2007年春季，学校开设专业25个，在校学生3600多人，成为广西沿海别具特色、富有竞争力的一所中等职业学校。
广西钦州农业学校贯彻和落实科学发展观。坚持“德育为首、全面发展”方针，坚持物质文明、精神文明、政治文明一起抓，全面推进学校发展。自1991年被国家有关部委授予“全国职业技术教育先进单位”、“全国科教兴农先进学校”以来，不骄不躁，奋力进取。1998年12月，被广西壮族自治区党委、广西壮族自治区人民政府授予“文明单位”称号，截至2007年底，学校先后被评为“全区科普工作先进集体”、“自治区级交通安全先进单位”、“广西绿色学校”、“广西职业教育先进单位”等称号。有4名教师先后被评为“全国教育系统劳动模范”、“全国中等农业学校优秀教师”、“自治区优秀党员”、“自治区优秀教师”称号，一名学生被国家民政部授予“革命烈士”称号。