1946 年3月，在郑家屯成立西满铁路管理局职工学校。同年 4 月 24 日 , 齐齐哈尔解放，学校由郑家屯迁到齐齐哈尔，1947 年 1 月改名为齐齐哈尔铁路管理局职工学校 ( 校址在今齐铁六中处）。建国后，1950 年3月，改名为齐齐哈尔铁路管理局技术学校。这次更名标志着学校由短期政治培训向短期技术培训的转变。

1952年10月，齐齐哈尔铁路管理局技术学校分为两校：一部分教工和在 职入学学员留在原校 , 并更名为齐齐哈尔铁路管理局职工学校 : 另一部分教 工和非在职学生迁入新校舍 ( 即现齐齐哈尔铁锋区工校街 15 号校址 ),校名仍为齐齐哈尔铁路管理局技术学校。这次一校分为两校 , 标志着齐齐哈尔铁路管理局技术学校由原先的短期培训向全日制正规中等专业学校的过渡。直到1953年3月 , 铁道部对全路各中等专业学校进行科组调整后 , 确定这所学校为培养铁道工程中级技术人才的学校 , 明确了专业和学制 , 并按照 省、部指示定名为齐齐哈尔铁路学校。 1955年1月 , 按铁道部指示 , 学校改名为齐齐哈尔铁路工程学校。其隶属关系为部、局双层领导（1983年10月以前为齐局，以后为哈局）。

从 1958 年秋开始到 1960 年,在全国教育革命中,两度办铁道学院,皆不足一年就下马,1958年勤工俭学 , 师生到生产一线参加房屋、线路的勘 测设计或施工,既锻炼了师,又为国家创造了财富 ; 既理论联系实际 , 提 高了学生实干能力 , 又为学校取得经济效益。与此同时 , 还举办师资班 , 为铁路中小学校培养了一批教师。 1958 年至 1960 年 , 学校教学人员编制呈现热 胀冷缩局面。

1960 年开始 , 连续三年处于特殊困难时期。由于校党委和行政领导一手 抓思想政治工作 ,一手抓生活 : 尽管当时师生员工人人处于饥馑状态 , 浮肿者众多 , 但职工无人缺勤 , 教师无人缺课 , 学生无人退学。师生员工人人精 神振奋 , 团结向上 , 共渡难关 , 保证了学校在曲折的道路上向前发展 , 使 1958 年增设的桥隧专业和干部班以及 1960 年为铁道兵部队代培学员的教学任务顺 利完成 , 并为 1964 年增设养路机械专业奠定了基础。

在十年浩劫时期 , 学校是文化大革命的前沿。从 1966 年 6 月红卫兵造反 开始 , 学校机构瘫痪 , 被迫停课。校领导和教工中有 63 人先后被关进 牛棚 。他们随时被揪斗。 1967 年 4 月军宣队进驻学校 ,1968 年 9 月撤出。是年同月工 宣队进驻学校 ,1977 年 12 月撤出。 1968 年至 1971 年 , 学校一度由齐铁基建工 程处接管。 1971 年 5 月 , 学校改名为齐齐哈尔铁路专业学校 , 党组织隶属齐 局直属机关党委领导。 1974 年 5 月 , 恢复原校名齐齐哈尔铁路工程学校至今。

学生在校参加 " 文革 "4个年头 , 到 1969 年 12 月最后一批一年级 6 个班全 部毕业终止。此后 , 教工则接受 " 再教育 ", 参加各种体力劳动。 1971 年 4 月 , 学校首批在省内招收下乡知识青年 ( 即工农兵学员〉办师范班 , 设中文、 英语、数、理、化等学科 , 为铁路普通中学培养师资。 1972 年又设置工程、 机辆、养机、运电、师范医务等 5 个专业科 , 开设了线路、房建、桥隧、养机、蒸汽、内燃、车辆、运输、通信、信号、中文、英语、理化、医士等班 , 在校生 600 余人。工农兵学员实行上、管、改。学制长短不一。教材现编现 选或到外校求援。教学管理不规范。尽管如此,在当时的情况下 , 把学校办 成这样一个规模 , 也是很不容易的。

1976 年 10 月 , 党中央一举粉碎了 " 四人帮 ", 结束了十年浩劫。学校经 过揭批 " 四人帮 " 的罪行 , 落实政策 , 冤假错案 ,1977 年恢复统考招生 , 1978 年初 , 发动广大教师深入现场调查研究 , 探索教改途径。通过上述工作 , 教学工作、教学秩序逐步恢复正常 , 为尔后的工作重点转移打下了基础。

八十年代中期 , 部、局开始投入专项资金兴建教学用房。进入九十年代 , 在两轮评估的推动下 , 部、局投资力度加大 , 加上自筹资金 , 先后建成办公 楼、实验馆楼、计算机中心楼、实习工厂楼、图书馆楼、第三、第四学生宿 舍楼、教学楼接层和学生第一、第二宿舍楼接层 , 扩建学生食堂、新建浴池、 演练中心楼等 , 加上种花植树 , 硬化地面 , 铺草坪 , 建景点 , 学校高楼崛起 ,景象壮观。

2000 年1月成立计算机中心 , 并接通国际互联网。新图书馆楼于 1992 年建成后 , 购书 经费逐年递增 , 库藏量 1984 年统计为 59423 册 , 到 2000 年为 13 万册 , 是 1984年的 219 倍。 1992 年通过评估 , 学校进入省级重点校 :2000 年再度评估 , 评 为国家级重点校。

由于国务院提出企业分离办社会职能，2004年9月份学校由哈尔滨铁路局移交到黑龙江省教育厅直接管理，学校成为省教育厅直属学校。

2004年11月，由于铁路企业实行主辅分离体制改革，学校由铁道部管理移交到省教育厅直属管理，此次移交翻开了学校办学历史上新的篇章，作为一个标志性的里程碑载入学校发展的史册！

2006年7月22日，学生公寓楼开始全面开工，该工程预计11月末主体工程交工。同年9月16日，学校举行了建校六十周年庆典大会，教育厅副厅长辛宝忠、副市长张云志、市长助理李智广参加了庆典仪式。